決済会社に連携される注文番号などのデータは任意の値に変更できますか？

Amazon Pay管理画面に表示される「販売事業者注文番号」をecforceの受注番号に変更したり、紐づけたりすることはできません。

「Amazon Pay」をご利用の場合は、仕様上、セラーセントラルの注文一覧で「販売業者注文番号」は「((任意項目)設定されていません)」と表示されます。
セラーセントラル上で受注の検索を行う場合は「取引ID（=リファレンスID）」などで確認ください。